Plataforma de Bioinformática

Esta plataforma é destinada ao desenvolvimento de pipelines de bioinformática e bioestatística para a resolução de problemas complexos proveniente de dados em larga escala. Esses pipelines e algoritmos (Python, C, R, shell script) são aplicados na análise das ciências Ômicas, principalmente Transcriptômica e Proteômica, direcionando o entendimento de processos celulares pouco explorados ou desconhecidos no contexto da imuno-inflamação.

Plataforma de Quimioproteômica

É uma metodologia que combina cromatografia de afinidade, crosslink proteico e proteômica por espectrometria de massas, e visa à identificação de alvos moleculares para desenvolvimento de novas drogas.

Plataforma de Microscopia

O Microscópio Confocal Leica TSC SP8 DSL Hyvolution é um equipamento completo que reúne diversas possibilidades. Além de ser um Confocal com quatro linhas de laser (405, 488, 552 e 638nm), ele contempla um sistema de super resolução e uma nova tecnologia chamada Lightsheet/DSL. O Hyvolution possibilita aumentar a resolução lateral podendo chegar a 140nm, que significa amostras com maior nível de detalhamento, principalmente em pequenas estruturas, e o DSL permite visualizar amostras grandes.

O High-Content Screening (HCS) é um sistema de microscopia de fluorescência e confocal que permite o screening de moléculas e a análise multiparamétrica de culturas de células em microplacas de até 1536 poços. O sistema é capaz de adquirir centenas de milhares de imagens de forma automatizada com alta resolução, tanto de células fixadas quanto vivas. Permite o monitoramento de processos celulares dinâmicos, pois possui temperatura ajustável, CO2 e umidade. A aquisição e a análise das imagens são realizadas de forma customizada pelo software MetaXpress.

Plataforma de Proteômica

Os equipamentos que compõem a espectrometria de massas no CENTD (nanoLC-EASY1200 e Q Exactive Plus) estão dedicados a análises de diferentes estratégias de proteômica baseada em espectrometria de massas. O equipamento permite a eficiente separação e a análise de proteínas e peptídeos em baixíssimas concentrações, cobrindo uma ampla faixa dinâmica de concentração em amostras biológicas complexas provenientes de organismos, tecidos, secreções, células ou vírus.

Plataforma de Biologia Molecular e Validação de Alvos Moleculares

Essa plataforma consiste em uma área especializada em técnicas de biologia molecular, como CRISPR/Cas9, RNAi e superexpressão gênica, para o desenvolvimento de linhagens celulares geneticamente modificadas ou silenciadas. Também conta com todos os equipamentos do CENTD (Citometria de Fluxo, Espectrômetro de Massas, High-Content Screening, Microscópio Confocal) para a caracterização funcional das linhagens geradas.

Plataforma de Citometria de Fluxo com Imagem e Multiplex

Citometria de imagem é uma técnica que reúne duas ferramentas importantes: a citometria de fluxo e a microscopia. Permite a quantificação da intensidade de fluorescência em células em suspensão e fornece imagens de todas as células analisadas, uma vez que é equipado com objetivas de microscopia de fluorescência. O sistema de análises Multiplex baseado em beads quantifica simultaneamente vários biomarcadores usando a tecnologia Luminex.